1、请患者头部保持不动，去除鼻前孔中表面的分泌物；
2、以拭子测量鼻尖到耳垂的距离并用手指做标记，将拭子以垂直鼻子（面部）方向插入鼻腔，当遇到阻力后即到达后鼻咽，使拭子在鼻内停留10~15 s，轻轻旋转3~5次取出试子。
采样者完全没有必要站立在患者正对面。侧位站立的优点是如果患者有咳嗽、打喷嚏等，可及时避开。鼻咽拭子通过鼻孔后，以垂直于头部冠状面或面部深入，从下鼻道深入抵达鼻咽后壁，有触墙感即可。鼻咽拭子进入鼻腔深度约为鼻尖到耳垂的距离。
《美国微生物学会临床微生物标本送检指南》要求，鼻咽拭子在鼻咽黏膜上要捻转，并保留10-15秒，然后取出。儿童配合度较差，实际操作中，我们一般充分捻转2-3次后，三五秒就取出拭子。
除了拭子进入深度要注意以外，还要注意的是，总有人习惯让患者充分仰头、折弯拭子，然后采样，以为这样才会取到合格标本。实际上，上述做法是错误的。这样操作会导致拭子头停留在不正确的位置，最终获得的样本其实不是规范的鼻咽拭子标本。